1. Le Conseil de l’Université (CU) est l’organe délibérant par excellence, présidé par le Recteur, le CU est l’instance de validation des orientations stratégiques, pédagogiques et scientifiques de l’UDH, conformément aux orientations définies par l’État en matière d’enseignement supérieur, de recherche scientifique et d’innovation.Conformément aux dispositions du décret n° 2021-852/PRN/MES/R du 7 octobre 2021 portant création, missions et organisation des UPN, le CU est chargé de la validation des rapports annuels d’activités de l’université. Il délibère sur le budget de l’université. A ce titre, il examine et adopte les prévisions budgétaires, le plan d’investissement, les états financiers, le patrimoine et le rapport annuel de l’université présenté par le Recteur.
Le Conseil d’Université est composé des représentants de l’État, des représentants de structures composant l’université, des représentants des structures bénéficiaires de ses activités et des personnalités extérieures. Le Conseil d’Université de l’UDH a été installé le 04 décembre 2017.

2. Le Conseil de Faculté/IUT est régi par l’arrêté n°0180 MES/R/I SG/DGE/DL du 24 novembre 2020 fixant l’organisation, le fonctionnent et les attributions des organes des Facultés, Écoles et Instituts des Universités Publiques du Niger (UPN).

En outre, il donne son avis sur les propositions de création de postes budgétaires ; les dossiers de recrutement aux postes d’enseignants-chercheurs et chercheurs (permanents ou contractuels) ; les questions se rapportant aux programmes et contrats de recherche ; les mises en position de stages ; les disponibilités ; les congés sabbatiques ; les dossiers de candidature au titre de Professeur Émérite ; les détachements.

A l’UDH, tous les Conseils de Faculté et d’IUT sont officiellement installés et opérationnels.

3. Le Conseil de Département est régi par l’arrêté n°0183 MES/R/I SG/DGE/DL du 24 novembre 2020 fixant l’organisation, le fonctionnent et les attributions des organes des Départements dans les Universités Publiques du Niger (UPN). Le Conseil de Département se réunit en session ordinaire une (1) fois par trimestre, sur convocation du chef de Département.  Il se réunit en session extraordinaire à la demande écrite des deux tiers (2/3) de ses membres ou sur convocation du chef de Département pour nécessités de service.  Le quorum pour la tenue des réunions est la majorité absolue des membres du conseil.

Le Président du Conseil d’Université, le Recteur et le Doyen/ Directeur reçoivent copie du procès-verbal dans le délai maximum de quinze (15) jours après la réunion.

Le Conseil de Département valide en début de chaque semestre le calendrier semestriel des enseignements. À la fin de chaque mois, il se réunit pour dresser l’état d’exécution des enseignements. Le Conseil de Département et / ou commission pédagogique autorise l'inscription des étudiants, dans le respect des règles et critères en la matière. Il valide les curricula avant leur transmission au rectorat.

A l’UDH, tous les Conseils de Département sont fonctionnels.

4. Le conseil scientifique de l’UDH a été créé par arrêté n°0059/MES/R/SG/DGE/DL du 15 avril 2022 portant création, composition et fonctionnement du Conseil scientifique de l’Université Djibo Hamani de Tahoua. Il a pour mission la programmation, l’organisation, la coordination et le contrôle de la recherche scientifique universitaire.

A l’UDH, le Conseil scientifique est officiellement installé et fonctionnel depuis juin 2022.

5. L’arrêté n°0043/MES/R/SG/DGE/DL du 31 mars 2022 détermine la composition et les modalités de fonctionnement du Conseil académique des UPN. En application de cet arrêté, le Conseil académique de l’UDH a été installé après la nomination des membres par arrêté n°000042/REC/SG/UDH/2022 portant nomination des membres du conseil académique de l’Université Djibo Hamani de Tahoua.

6. La Cellule Assurance Qualité (CAQ/LMD) a été créée le 17 juin 2014. Mais l’arrêté de régularisation n’est intervenu qu’en 2016 à travers l’arrêté n° 35/REC/SG/UTA du 30 octobre 2016, portant création, composition et attributions d’une Cellule Assurance Qualité à l’UDH. La Cellule assure la diffusion au sein de l’Université Djibo Hamani de Tahoua des principes de l’Assurance Qualité.

La Cellule assure le suivi de la mise en œuvre du programme national d’action en vue de l’amélioration continue de la qualité des programmes de la formation, de la recherche et du fonctionnement institutionnel. Elle s’approprie et veille à la mise en œuvre des guides et référentiels du Conseil Africain et Malgache pour l’Enseignement Supérieur (CAMES).

La Cellule suit l’évolution des dispositions en matière d’Assurance Qualité tant au niveau national qu’international. Sur cette base, elle élabore les procédures et les documents nécessaires à l’évaluation interne.